As bolsas são obtidas diretamente nas Instituições de Ensino Superior e Pesquisa a partir de processos seletivos conduzidos pelos programas de pós-graduação. Todos os cursos de mestrado e doutorado acadêmicos avaliados e recomendados pela CAPES com nota igual ou superior a três podem dispor de uma cota de bolsa.

Os mestrados profissionais não tem bolsa,  as instituições de fomento entendem que o mestrando já está no mercado de trabalho e, portanto, possui condições financeiras para bancar o curso.